Журнал
Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики
УДК:519.1
Номер:6 (130)
МОДИФИКАЦИЯ МЕТОДА СОВМЕСТНОЙ КЛАСТЕРИЗАЦИИ В ГРАФОВОМ И КОРРЕЛЯЦИОННОМ ПРОСТРАНСТВАХ
Аннотация:
Предмет исследования. Метод совместной кластеризации в графовом и корреляционном пространствах предназначен для идентификации активных модулей в метаболических графах на основании транскриптомных данных, представленных большим числом образцов. Получаемые с помощью данного метода активные модули описывают динамическую метаболическую регуляцию во всех образцах анализируемого набора данных. В работе изложены способы модификации предложенного метода для применения на реальных данных. Метод. Для изучения устойчивости получаемых результатов модифицированный метод был многократно запущен на реальных данных с небольшими вариациями исходных параметров. Для анализа результатов сформулировано несколько метрик, отражающих степень похожести и представленности полученных при разных запусках модулей. Основные результаты. Результаты анализа в целом являются достаточно устойчивыми: для большинства модулей их профили хорошо находятся в шумных данных, а также сохраняется большинство генов этих модулей. Практическая значимость. Результаты приведенных исследований показали, что используемые модификации метода позволяют успешно анализировать реальные данные путем получения активных модулей, обладающих устойчивостью и простотой в интерпретации.
Ключевые слова:
Постоянный URL
Статьи в номере
- ИСПОЛЬЗОВАНИЕ НАВЕДЕННЫХ МЕХАНИЧЕСКИХ НАПРЯЖЕНИЙ ПРИ ФОРМООБРАЗОВАНИИ СФЕРИЧЕСКИХ ПОВЕРХНОСТЕЙ ПОДЛОЖЕК ИНТЕРФЕРЕНЦИОННЫХ ЗЕРКАЛ
- ИССЛЕДОВАНИЕ ИЗМЕНЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ НАКЛОННОЙ ВОЛОКОННОЙ БРЭГГОВСКОЙ РЕШЕТКИ ПРИ ЕЕ ХИМИЧЕСКОМ ТРАВЛЕНИИ
- ОСОБЕННОСТИ ПРИМЕНЕНИЯ ОПТИЧЕСКИХ ПОЛИМЕРОВ ПРИ ПРОЕКТИРОВАНИИ ОПТИЧЕСКИХ СИСТЕМ
- ОЦЕНКА ВЛИЯНИЯ РАСТИТЕЛЬНЫХ ЭКСТРАКТОВ НА АКТИВНОСТЬ ЗОЛОТИСТОГО СТАФИЛОКОККА МЕТОДОМ ЭЛЕКТРОХИМИЧЕСКОГО БИОТЕСТИРОВАНИЯ
- БЫСТРЫЙ АЛГОРИТМ ОЦЕНКИ ДВИЖЕНИЯ В ВИДЕОКОДЕКЕ СТАНДАРТА HEVC
- ПРИМЕНЕНИЕ КОНЦЕПЦИИ ЦИФРОВЫХ ДВОЙНИКОВ НА ЭТАПАХ ЖИЗНЕННОГО ЦИКЛА ПРОИЗВОДСТВЕННЫХ СИСТЕМ
- ОПТИМИЗАЦИЯ ГИПЕРПАРАМЕТРОВ НА ОСНОВЕ ОБЪЕДИНЕНИЯ АПРИОРНЫХ И АПОСТЕРИОРНЫХ ЗНАНИЙ О ЗАДАЧЕ КЛАССИФИКАЦИИ
- ВЫВОД ГЕННЫХ РЕГУЛЯТОРНЫХ СЕТЕЙ ПО ДАННЫМ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ ПРИ ПОМОЩИ БАЙЕСОВСКИХ СЕТЕЙ
- ПРИМЕНЕНИЕ ИНКРЕМЕНТАЛЬНЫХ SAT-РЕШАТЕЛЕЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ NP-ТРУДНЫХ ЗАДАЧ НА ПРИМЕРЕ ЗАДАЧИ СИНТЕЗА МИНИМАЛЬНЫХ БУЛЕВЫХ ФОРМУЛ
- ОЦЕНИВАНИЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЯ ОТРАЖАТЕЛЬНЫХ ХАРАКТЕРИСТИК ПРИ КВАЗИНЕПРЕРЫВНОМ СВЕРХШИРОКОПОЛОСНОМ ЗОНДИРУЮЩЕМ СИГНАЛЕ
- АДАПТИВНАЯ ЗАДАЧА О РАСШИРЕННОМ ВОСПРОИЗВОДСТВЕ ПРИ МИНИМИЗАЦИИ ОБОБЩЕННЫХ ЗАТРАТ
- ПРЕДСКАЗАНИЕ УСЛОВИЙ РЕАКЦИЙ С ПОМОЩЬЮ МЕТОДОВ ГЛУБОКОГО ОБУЧЕНИЯ
- МОДЕЛИРОВАНИЕ ВЕРТИКАЛЬНЫХ СВЕТИЛЬНИКОВ ДЛЯ ДНЕВНОГО ОСВЕЩЕНИЯ ВНУТРЕННИХ ПОМЕЩЕНИЙ ПРОМЫШЛЕННЫХ ЗДАНИЙ(на англ. яз.)
- УРАВНЕНИЕ СОСТОЯНИЯ ПОЛИМЕРНЫХ НИТЕЙ
- ПРОГНОЗИРОВАНИЕ МЕХАНИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ОДНОМЕРНЫХ ПОЛИМЕРНЫХ СТРУКТУР
- ПРИМЕНЕНИЕ МЕТОДА НЕЗАВИСИМЫХ КОМПОНЕНТ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ НАЧАЛЬНОГО ПРИБЛИЖЕНИЯ ПРИ ПОИСКЕ АКТИВНЫХ МОДУЛЕЙ В БИОЛОГИЧЕСКИХ ГРАФАХ
- СИСТЕМА ПОДДЕРЖКИ КЛИНИЧЕСКИХ РЕШЕНИЙ С ОБРАБОТКОЙ МУЛЬТИМОДАЛЬНЫХ МЕДИЦИНСКИХ ДАННЫХ КАК СРЕДСТВО ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ РАБОТЫ ВРАЧА-РАДИОЛОГА